Каков Агарозный гель?
Агарозный гель - вещество, которое используется в науке для вытеснительной хроматографии размера и электрофореза в геле. Эти процессы используют агарозный гель, чтобы отделить и проанализировать белки и ДНК. Среда составлена из очищенного порошка агарозы, который был кипячёным в буферном растворе и затем охлажден в гель.
Агарозный гель обычно связан с электрофорезом в геле. В этой процедуре ученые используют электрический налог, чтобы переместить дезоксирибонуклеиновую кислоту, более обычно известную как ДНК, или рибонуклеиновая кислота (РНК) через матрицу геля к уверенному полюсу. Поскольку молекулы должны переместиться через маленькие отверстия в связи решетки в агарозном геле, меньшие молекулы перемещаются намного быстрее чем большие молекулы. Используя ультрафиолетовое отображение движения молекул и формулы, которая связывает молекулярную массу со скоростью путешествия через гель, ученые могут определить размер молекул.
Агароза извлечен в форме агар-агара от нескольких разновидностей красных морских морских водорослей, или морской водоросли, найденной в Калифорнийской и восточной Азии. Агар-агар, термин, полученный из малайского слова агар-агар , означая гель, обычно получен из <них> Gelidium рода морской водоросли. Это составлено и из агарозы и из agaropectin молекул и оказывает поддержку клеточным стенкам в пределах морских морских водорослей. Удаленный из растения, agarcan использоваться в качестве продовольственного загущающего агента, очень как желатин, слабительное, или среда для того, чтобы вырастить бактерии, плесень, или другие микроорганизмы, когда очищено.
Довольно легко отделить агарозу от agaropectin в агар-агаре, потому что связь молекул агарозы сильно друг другу, в то время как agaropectin застудневает плохо. Есть несколько методов, чтобы достигнуть изоляции агарозного геля. В одном методе carrageenan, другая молекула, найденная в красной морской водоросли, и соли, добавлены к агар-агару. Это заставляет agaropectin осаждать, или формировать тело, которое может быть удалено из раствора агар-агара. Другой метод добавляет фермент pectinase, химикат, который ломает agaropectin, к раствору, позволяя agaropectin раствориться в воде.
Изолированная агароза может тогда быть заказана лабораториями, обычно в форме дорогого порошка. Подготовка агарозного геля от этого порошка зависит от качества изображения и размера фрагментов ДНК, необходимых для электрофореза. Гель подготовлен на различных концентрациях, обычно 1.2 %, 1 %, 0.8 %, 0.7 %. Если бы один хотел сделать гель на 0.7 %, то она должна добавить отношение 0.7 граммов (g) порошка агарозы к 100 миллилитрам (мл) буферного раствора, таким как Трис-Асетэйт-ЭДТа, или ТЭ. Отношение может быть умножено или разделено, чтобы приспособить количество агарозы и буфера пропорционально, чтобы привести к меньшему или большему количеству геля.
Как только правильное количество изделий было комбинировано в колбе, это должно микроразвиваться, пока содержание полностью не плавится. В то время как раствор - все еще жидкость, бромид этидия (EtBr), химикат, который позволяет ДНК или РНК быть замеченной в Ультрафиолетовом свете, должен быть добавлен в порции 1/1000, если раствор EtBr на концентрации 0.5mg/mL. Раствору нужно позволить охладиться в течение нескольких минут и затем влит колодцы в тарелке электрофореза, где нужно позволить укрепиться в гель.